Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nde1Q9CZA6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms