Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
3100002H09RikQ9CXW6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms