Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT6

Kdm8, JmjC domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm8Q9CXT6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kdm8Q9CXT6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Kdm8Q9CXT6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kdm8Q9CXT6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kdm8Q9CXT6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kdm8Q9CXT6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kdm8Q9CXT6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kdm8Q9CXT6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kdm8Q9CXT6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kdm8Q9CXT6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kdm8Q9CXT6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Kdm8Q9CXT6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kdm8Q9CXT6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kdm8Q9CXT6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kdm8Q9CXT6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kdm8Q9CXT6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kdm8Q9CXT6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kdm8Q9CXT6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kdm8Q9CXT6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kdm8Q9CXT6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kdm8Q9CXT6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kdm8Q9CXT6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kdm8Q9CXT6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kdm8Q9CXT6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kdm8Q9CXT6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kdm8Q9CXT6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kdm8Q9CXT6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kdm8Q9CXT6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kdm8Q9CXT6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kdm8Q9CXT6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kdm8Q9CXT6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kdm8Q9CXT6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms