Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm5Q9CXE0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms