Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mgme1Q9CXC3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms