Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXB8

Alpk1, Alpha-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk1Q9CXB8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Alpk1Q9CXB8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Alpk1Q9CXB8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Alpk1Q9CXB8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Alpk1Q9CXB8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Alpk1Q9CXB8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Alpk1Q9CXB8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Alpk1Q9CXB8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Alpk1Q9CXB8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Alpk1Q9CXB8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Alpk1Q9CXB8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Alpk1Q9CXB8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Alpk1Q9CXB8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Alpk1Q9CXB8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Alpk1Q9CXB8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Alpk1Q9CXB8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Alpk1Q9CXB8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Alpk1Q9CXB8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Alpk1Q9CXB8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Alpk1Q9CXB8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Alpk1Q9CXB8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Alpk1Q9CXB8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Alpk1Q9CXB8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Alpk1Q9CXB8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Alpk1Q9CXB8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Alpk1Q9CXB8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Alpk1Q9CXB8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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