Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RpainQ9CWY9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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