Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms