Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ly6kQ9CWP4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ly6kQ9CWP4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ly6kQ9CWP4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ly6kQ9CWP4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ly6kQ9CWP4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ly6kQ9CWP4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ly6kQ9CWP4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ly6kQ9CWP4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ly6kQ9CWP4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ly6kQ9CWP4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ly6kQ9CWP4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ly6kQ9CWP4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ly6kQ9CWP4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ly6kQ9CWP4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ly6kQ9CWP4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ly6kQ9CWP4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ly6kQ9CWP4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ly6kQ9CWP4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ly6kQ9CWP4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ly6kQ9CWP4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms