Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms