Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
4930553M12RikQ9CUH1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms