Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sft2d3Q9CSV6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms