Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msmo1Q9CRA4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msmo1Q9CRA4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Msmo1Q9CRA4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msmo1Q9CRA4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msmo1Q9CRA4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msmo1Q9CRA4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msmo1Q9CRA4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Msmo1Q9CRA4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Msmo1Q9CRA4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Msmo1Q9CRA4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Msmo1Q9CRA4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Msmo1Q9CRA4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Msmo1Q9CRA4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Msmo1Q9CRA4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Msmo1Q9CRA4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Msmo1Q9CRA4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Msmo1Q9CRA4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msmo1Q9CRA4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms