Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS8

Sec61b, Protein transport protein Sec61 subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61bQ9CQS8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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