Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms