Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Chchd5Q9CQP3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chchd5Q9CQP3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chchd5Q9CQP3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chchd5Q9CQP3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Chchd5Q9CQP3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chchd5Q9CQP3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chchd5Q9CQP3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chchd5Q9CQP3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chchd5Q9CQP3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chchd5Q9CQP3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chchd5Q9CQP3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chchd5Q9CQP3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chchd5Q9CQP3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chchd5Q9CQP3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chchd5Q9CQP3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chchd5Q9CQP3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chchd5Q9CQP3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chchd5Q9CQP3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chchd5Q9CQP3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms