Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc2Q9CQP2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms