Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sar1bQ9CQC9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms