Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc5Q9CQA1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trappc5Q9CQA1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms