Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Mrpl49Q9CQ40 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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