Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc198Q9CPZ1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms