Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg3Q9CPX6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atg3Q9CPX6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms