Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE9

Arl4d, ADP-ribosylation factor-like protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl4dQ99PE9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arl4dQ99PE9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arl4dQ99PE9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Arl4dQ99PE9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arl4dQ99PE9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arl4dQ99PE9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Arl4dQ99PE9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arl4dQ99PE9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arl4dQ99PE9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arl4dQ99PE9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arl4dQ99PE9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Arl4dQ99PE9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arl4dQ99PE9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arl4dQ99PE9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Arl4dQ99PE9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arl4dQ99PE9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Arl4dQ99PE9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl4dQ99PE9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl4dQ99PE9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl4dQ99PE9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl4dQ99PE9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl4dQ99PE9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl4dQ99PE9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl4dQ99PE9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl4dQ99PE9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arl4dQ99PE9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms