Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nup155Q99P88 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nup155Q99P88 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nup155Q99P88 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Nup155Q99P88 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms