Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH0

Ankrd17, Ankyrin repeat domain-containing protein 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd17Q99NH0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ankrd17Q99NH0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd17Q99NH0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms