Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rims1Q99NE5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rims1Q99NE5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms