Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b1Q99NB9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sf3b1Q99NB9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms