Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Acss1Q99NB1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms