Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brms1Q99N20 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Brms1Q99N20 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Brms1Q99N20 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brms1Q99N20 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms