Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac9Q99N13 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms