Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a6cQ99N08 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms