Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramel1Q99MW3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramel1Q99MW3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramel1Q99MW3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramel1Q99MW3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramel1Q99MW3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramel1Q99MW3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramel1Q99MW3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramel1Q99MW3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramel1Q99MW3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramel1Q99MW3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramel1Q99MW3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramel1Q99MW3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramel1Q99MW3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramel1Q99MW3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramel1Q99MW3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramel1Q99MW3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramel1Q99MW3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramel1Q99MW3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramel1Q99MW3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramel1Q99MW3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramel1Q99MW3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramel1Q99MW3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramel1Q99MW3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramel1Q99MW3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramel1Q99MW3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramel1Q99MW3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramel1Q99MW3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramel1Q99MW3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramel1Q99MW3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pramel1Q99MW3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pramel1Q99MW3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramel1Q99MW3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms