Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BrapQ99MP8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms