Protein–RNA interactions for Protein: Q99ML1

Bbc3, Bcl-2-binding component 3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbc3Q99ML1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbc3Q99ML1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms