Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp1b1Q99LU0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp1b1Q99LU0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp1b1Q99LU0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp1b1Q99LU0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp1b1Q99LU0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp1b1Q99LU0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chmp1b1Q99LU0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp1b1Q99LU0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp1b1Q99LU0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp1b1Q99LU0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp1b1Q99LU0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp1b1Q99LU0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp1b1Q99LU0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp1b1Q99LU0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp1b1Q99LU0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp1b1Q99LU0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp1b1Q99LU0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chmp1b1Q99LU0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp1b1Q99LU0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp1b1Q99LU0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp1b1Q99LU0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms