Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Rcbtb2Q99LJ7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms