Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pagr1aQ99L02 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pagr1aQ99L02 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms