Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf34Q99KR6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms