Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Def8Q99J78 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Def8Q99J78 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Def8Q99J78 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Def8Q99J78 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms