Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms