Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b5Q923D4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms