Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nrif1Q923B3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrif1Q923B3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms