Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sf3b3Q921M3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sf3b3Q921M3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms