Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med28Q920D3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms