Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarca5Q91ZW3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarca5Q91ZW3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms