Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx18Q91ZR2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms