Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Pde6cQ91ZQ1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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Pde6cQ91ZQ1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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Pde6cQ91ZQ1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Pde6cQ91ZQ1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Pde6cQ91ZQ1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pde6cQ91ZQ1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Pde6cQ91ZQ1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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