Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc5a4bQ91ZP4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc5a4bQ91ZP4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms