Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cts3Q91ZD5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cts3Q91ZD5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cts3Q91ZD5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cts3Q91ZD5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cts3Q91ZD5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cts3Q91ZD5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cts3Q91ZD5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cts3Q91ZD5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cts3Q91ZD5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cts3Q91ZD5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cts3Q91ZD5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cts3Q91ZD5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cts3Q91ZD5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cts3Q91ZD5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms