Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp1bQ91YK2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp1bQ91YK2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp1bQ91YK2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp1bQ91YK2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp1bQ91YK2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rrp1bQ91YK2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp1bQ91YK2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp1bQ91YK2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp1bQ91YK2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp1bQ91YK2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp1bQ91YK2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp1bQ91YK2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp1bQ91YK2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp1bQ91YK2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp1bQ91YK2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp1bQ91YK2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp1bQ91YK2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rrp1bQ91YK2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rrp1bQ91YK2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrp1bQ91YK2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrp1bQ91YK2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrp1bQ91YK2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrp1bQ91YK2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrp1bQ91YK2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrp1bQ91YK2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp1bQ91YK2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp1bQ91YK2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp1bQ91YK2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp1bQ91YK2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp1bQ91YK2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp1bQ91YK2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp1bQ91YK2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp1bQ91YK2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp1bQ91YK2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp1bQ91YK2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp1bQ91YK2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp1bQ91YK2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp1bQ91YK2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp1bQ91YK2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms